Il 6 ottobre ha ufficializzato la sua candidatura alla primarie della coalizione di centrosinistra; giovedì 25 ottobre, il Tribunale di Bari ha chiesto nei suoi confronti una condanna ad un anno e otto mesi per abuso d’ufficio, all’interno dell’inchiesta sulla sanità pugliese e del processo con rito abbreviato richiesto dallo stesso Presidente della Regione Puglia; carica che ricopre dal 2005 riconfermata per il secondo mandato, il 29 marzo 2010, in controtendenza con l’andamento delle elezioni amministrative di due anni fa, vinte dal PdL e in parziale contrapposizione col maggior partito della sua coalizione, il Pd; dall’ottobre 2010 è Presidente di Sinistra Ecologia Libertà, formazione politica nata nel 2009 dopo la scissione di Rifondazione Comunista, partito di cui è stato deputato dal 1992 e per quattro Legislature consecutive; nel 1985 è tra i fondatori dell’ Arcigay nazionale e nel 1987 della Lila – Lega italiana per la lotta contro l’Aids.